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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202210487983.0 (22)申请日 2022.05.06 (71)申请人 武汉希望组生物科技有限公司 地址 430076 湖北省武汉市东湖新 技术开 发区花城大道8号武汉软件新城二期 C11栋19层 (72)发明人 梁帆 全伟鹏 李净净 汪德鹏  (74)专利代理 机构 东莞市卓易专利代理事务所 (普通合伙) 44777 专利代理师 张晓华 (51)Int.Cl. C12Q 1/70(2006.01) C12Q 1/6844(2018.01) C12N 15/11(2006.01) C12R 1/93(2006.01) (54)发明名称 基于LAMP检测传染性疾病病毒的引物组、 试 剂盒及测序方法 (57)摘要 本发明提供了一种基于LAMP快速检测传染 性疾病病毒的引物组、 试剂盒及测序方法, 涉及 生物检测技术领域。 所述传染性疾病选自SARS ‑ CoV‑2或流感病毒B, 所述引物组包括特异性扩增 SARS‑CoV‑2病毒arf1ab和N基因的引物对, 如Seq   ID No.1~12所示, 或特异性扩增流感病毒B的HA 基因和M基因的引物对, 如Seq  ID No.13~24所 示, 同时, 引物组还包括特异性扩增作为内参基 因的GAPDH的引物对, 如Seq  ID No.25~30所示。 本发明提供的引物组、 试剂盒及测序方法可在2 小时内检出低至32 5copies/mL的目标物, 与传统 的qPCR检测相比, 可以实现快速、 高效、 高准确的 检测。 权利要求书2页 说明书10页 序列表5页 附图1页 CN 114752708 A 2022.07.15 CN 114752708 A 1.一种基于LAMP快速检测传染性疾病病毒的引物组, 其特征在于, 所述传染性疾病选 自SARS‑CoV‑2或流感病毒B, 所述引物组包括特异性扩增SARS ‑CoV‑2病毒arf1ab和N基因的 引物对, 如Seq  ID No.1~12所示, 或特异性扩增流感病毒B的HA基因和M基因的引物对, 如 Seq ID No.13~24所示, 同时, 引物组还包括特异性扩增作为内参基因的GAPDH的引物对, 如Seq ID No.25~30所示。 2.一种基于LAMP快速检测传染性疾病病 毒的试剂盒, 其特征在于, 包含如权利要求1所 述的SARS ‑CoV‑2病毒arf1ab和N基因的引物对和/或流感病毒B的HA基因和M基因的引物对。 3.根据权利要求2所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒的试剂盒, 其特征在于, 包 括以下成分: 组分 浓度 Isothermal  Amplification Buffer 10× MgSO4100mmol/L dNTP Mix 10mmol/L FIP/BIP Primers 25× F3/B3 Primers 25× LoopF/B Primers 25× Bst2.0 DNA Polymerase 8,000U/ml Nuclease ‑free Water ‑ 4.一种基于LAMP快速检测传染性疾病 病毒序列的方法, 其特 征在于, 包括以下步骤: S41: 对待检样品提取质粒样本, 获得DNA  Sample; S42: 进行LAMP反应, 并对反应产物进行 纯化, 其中, 每25 μL体积的LAMP反应 体系为: 试剂 添加量 10×Isothermal  Amplification Buffer 2.5 μl MgSO4(100mmol/L) 1.5 μl dNTP Mix(10mmol/L) 3.5 μl FIP/BIP Primers(25 ×) 1 μl F3/B3 Primers(25 ×) 1 μl LoopF/B Primers(25 ×) 1 μl Bst2.0 DNA Polymerase(8,0 00U/ml) 1 μl DNA Sample 10 μl Nuclease ‑free Water 至25 μl S43: 取步骤S42中纯化后的LAMP产物与Fragmentation  Mix RB01‑12混合反应, 待反应 完全后, 冰浴降温, 再使用AMPure  beads纯化, 将纯化后的产物与RAP混合, 室温孵育, 连接 测序接头; S44: 上样, 采用Nan opore平台测序。 5.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在于, 所述步骤S41中, DNA  Sample的制备方式为: 将提取获得的质粒样本行等量混合, 并将其浓 度调整至 3.25×105copies/mL。权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114752708 A 26.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在于, 所述步骤S42中, LAMP反应在6 5℃条件下反应3 0min。 7.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在于, 所述步骤S42中, 反应产物使用35 μl  AMPure XP beads、 Qubit  dsDNA HS Assay Kit进行纯 化。 8.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在于, 所述步骤S43中, 纯化后的LAMP产物与Fragmentation  Mix RB01‑12的体积比为3:1, 先30℃ 反应1min, 然后80℃反应1mi n, 再冰浴降温。 9.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在于, 所述步骤S43中, 使用AMPure  beads纯化的方法为: 向反应产物中加入等体积AMPure   beads, 室温孵育15min, 再室温磁力架吸附5min, 弃上清; 加 入70%乙醇, 磁力架吸附, 弃上 清, 重复一次; 室温晾干; 加入终浓度为20mmol/L、 pH为7.5 ‑8.0的Tris ‑HCl溶液和终浓度为 100mmol/L的NaCl溶液共10ul, 其中Tris ‑‑HCl溶液与NaCl溶液的体积比为1:1, 室温孵育 2min; 磁力架上静置 5min, 吸取上清, 即为纯化后的产物。 10.根据权利要求4所述的基于LAMP快速检测传染性疾病病毒序列的方法, 其特征在 于, 所述步骤S43中, RAP与纯化后的产物的体积比为1:10 。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114752708 A 3

PDF文档 专利 基于LAMP检测传染性疾病病毒的引物组、试剂盒及测序方法

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